Источник: http://review-gadget.com.

"КОНСТРУКТОР КРАСНОГО ЦВЕТА"

Open Source на молекулярном уровне

Ученые лаборатории структурной геномики из шведского медицинского университета Karolinska Institutet опубликовали трехмерную пространственную структуру одного из жизненно важных белков человека, которая может помочь в разработке новых противоопухолевых препаратов. Это будет уже четырехсотый белок, пространственная структура которого установлена упомянутой лабораторией, организованной как совместный проект нескольких научных учреждений.

Возникновение многих болезней вызвано неправильным функционированием белков организма, участвующих в важных биохимических реакциях. Сбои в работе белковых молекул обусловлены нарушениями их пространственной структуры, неверной укладкой полипептидных цепей. Такое нарушение может быть вызвано либо генетическими дефектами, либо внешними воздействиями. Чтобы разработать эффективный препарат для лечения ряда болезней, необходимо перевести белок в естественную форму или заставить его функционировать так, будто он "не сломался". Для этого (и не только) нужно знать пространственную структуру белковых молекул.

Изучением взаимосвязи структуры белков с их функциями занимались давно в рамках молекулярной биологии и биохимии. Но сегодня исследование всей совокупности белков организма (протеома) выделено в новое направление - протеомику. Молекулы белков, как правило, состоят из сотен и тысяч атомов, поэтому экспериментальное исследование структуры белка сопряжено с рядом технических трудностей. Кроме того, изучать структуру белка лучше в его естественной "среде обитания" - живом организме. Здесь все большее влияние приобретает новейшая область - вычислительная протеомика, возникновение которой напрямую связано с ростом производительности вычислительной техники и развитием методов параллельных вычислений. Последние особенно эффективны при моделировании поведения молекул в динамике, в среде растворителя. Вычислительная протеомика позволяет предсказать пространственную структуру белка исходя из его первичной структуры, то есть на основании последовательности аминокислот, и прогнозировать химические свойства протеинов на базе экспериментальных структурных данных.

Как экспериментальные, так и теоретические структурные исследования белков - очень наукоемкая и затратная область исследований. Примечательно, что шведы готовы свободно предоставить структурные данные по белкам человека всем заинтересованным ученым. Является ли благом этот акт душевной широты - вопрос спорный. Зная молекулярную структуру жизненно важных белков человека, с помощью тех же методов компьютерной химии можно разработать как лекарство, так и эффективнейшее химическое оружие. Шведские исследователи освобождают других ученых от самого длительного и сложного начального этапа на пути таких разработок - определения структуры "целевого" белка. Остается надеяться, что новые виды "атомной бомбы для бедных" на основе белковых структурных данных появятся не раньше, чем эффективные противоядия на основе этих же данных. ЕГ

http://offline.computerra.ru/offline/2007/683/315460/

Британским ученым разрешили создавать эмбрионы химер

Правительство Британии пересмотрело запрет на создание гибридных эмбрионов и собирается разрешить исследования некоторых определенных видов гибридов, пишет The Guardian.

По информации издания, ученые теперь смогут создавать три вида эмбрионов путем смешивания генетических материалов человека и животных. Однако их можно будет выращивать в лабораторных условиях не более двух недель и будет запрещено имплантировать их в человеческий организм.

Среди разрешенных к созданию видов эмбрионов есть химерный, который получают путем введения клеток животного в человеческий эмбрион, человеческий трансгенный, получаемый путем введения ДНК животного в эмбрион человека, а также цитоплазматический, который создается при пересадке ядер клеток человека в почти полностью очищенную от генетического материала яйцеклетку животного.

Тем не менее, новые правила не позволят создавать так называемые "настоящие гибридные" эмбрионы, получаемые путем оплодотворения яйцеклеток животных человеческими или наоборот - яйцеклеток человека животными.

Несколько ученых уже подали в Управление по оплодотворению и эмбриологии человека Великобритании заявки на получение лицензии для использования гибридных эмбрионов в проведении медицинских исследований. Как полагают ученые, эти исследования могут помочь открыть новые способы лечения таких болезней, как диабет, спинномозговой паралич, а также считающихся в настоящее время неизлечимыми болезней Паркинсона и Альцгеймера.

http://lenta.ru/news/2007/05/18/embryo/

Дорогу стволовым клеткам!

Верховный суд Калифорнии отказался рассматривать иск, инициаторы которого требуют запретить программу изучения человеческих стволовых клеток. Это решение окончательно лишает противников программы шансов на успех и открывает путь к ее практической реализации.

Программа научных исследований, нацеленных на поиск методов лечения различных заболеваний с помощью стволовых клеток, была утверждена на общекалифорнийском референдуме, который состоялся в 2004 году. Ее инициаторами стали состоятельные жители штата, чьи родственники страдают сахарным диабетом и другими заболеваниями, которые предполагается лечить с помощью стволовых клеток. Эта инициатива нашла сильную поддержку в университетах и биотехнологических компаниях, а также в Голливуде. За две недели до голосования в ее пользу высказался даже губернатор штата Арнольд Шварценеггер. Сторонники проекта собрали на пропаганду 20 млн. долларов и использовали эти деньги весьма эффективно. Их противникам, которых возглавил знаменитый актер Мел Гибсон, не удалось накопить и миллиона. В результате проект одобрили почти 60% калифорнийцев, пришедших на избирательные участки.

Эта инициатива очень интересна в юридическом плане. Она не просто санкционировала работы с человеческими стволовыми клетками любых типов, в том числе и эмбриональных, но и придала таким исследованиям статус конституционного права. Разумеется, речь идет не о федеральной конституции США, а о конституции Калифорнии. Для обеспечения практической реализации проекта, власти штата выпустят облигации займа на общую сумму три миллиарда долларов. Эти средства будут в течение десяти лет приблизительно равными долями направляться на финансирование биомедицинских проектов, связанных с применением стволовых клеток. Получателям таких грантов не возбраняется клонировать человеческие эмбрионы с целью использования их клеток в лечебных целях (так называемое терапевтическое клонирование), однако строго запрещается выращивать из этих эмбрионов даже двух-трехнедельных зародышей, не говоря уже о младенцах. Для осуществления этой программы создана специальная организация - Калифорнийский Институт регенеративной медицины. Его работу контролирует независимый комитет, куда вошли представители научных центров, врачебных кругов и общественных групп.

Вскоре после объявления результатов референдума его оппоненты образовали коалицию, которая решила продолжить борьбу в суде. В нее вошли радикальные противники абортов, а также сторонники сокращения налогов. До сих пор им удавалось оттягивать запуск программы, однако вердикт Верховного Суда Калифорнии кладет конец этим усилиям. В июне штат начнет выпуск первого пакета облигаций на сумму в 300 миллионов долларов, которые пойдут на финансирование исследований стволовых клеток в течение одного года. Однако фактически Институт регенеративной медицины начал работать, поскольку еще до завершения судебной эпопеи он получил 150-миллионный заем от казначейства штата и еще 8 миллионов из других источников. В итоге Институт уже вышел на первое место в мире по финансовым ресурсам среди организаций, которые занимаются биомедицинскимии исследованиями человеческих стволовых клеток. АЛ

http://offline.computerra.ru/offline/2007/688/320626/